O fundo documental da Biblioteca do INSA constituiu-se a partir do acervo da extinta Junta de Saúde Pública (criada em 1813) e do Laboratório de Higiene de Lisboa (fundado em 1881), incorporado neste Instituto a 24 de Dezembro de 1901. A colecção foi inicialmente actualizada com obras adquiridas pela Direcção-Geral de Saúde desde a sua criação em 1899, ofertas de publicações nacionais e estrangeiras e ainda com as sucessivas ofertas do director-fundador do Instituto, o Doutor Ricardo Jorge.
O fundo actual é composto por 9350 monografias e 420 títulos de publicações periódicas, nacionais e estrangeiras, nos domínios de acção e investigação do INSA: Genética Humana, Citogenética, Oncobiologia, Biopatologia Clínica e Hematologia, Epidemiologia e Biostatística, Doenças Infecciosas, Virologia, Bacteriologia, Parasitologia, Micologia, Segurança Alimentar e Nutrição, Toxicologia dos Alimentos, Microbiologia dos Alimentos, Microbiologia e Química das Águas, Alcoologia, Saúde Ambiental e Saúde Ocupacional.
As espécies bibliográficas estão organizadas em duas grandes colecções:
Fundo Reservado - composto por 3150 espécies bibliográficas de valor histórico e patrimonial, publicadas até 1960. Fazem parte integrante da colecção, textos escritos pelo Professor Ricardo Jorge e ensaios sobre a sua obra e personalidade (Bibliografia Ricardiana), sendo também de acesso reservado obras de outras figuras ilustres do Instituto.
Fundo Geral - reúne 6200 monografias e 420 títulos de publicações periódicas, nacionais e estrangeiras. Estão compreendidas as obras editadas pela Organização Mundial da Saúde (OMS), na qualidade de Biblioteca de Referência desde 1986, e a denominada literatura cinzenta, constituída sobretudo por dissertações de doutoramento e de mestrado, e trabalhos técnicos desenvolvidos pelos investigadores e técnicos do Instituto.
A colecção integra ainda núcleos bibliográficos que têm vindo a ser incorporados na Biblioteca do INSA provenientes de extintos serviços do Ministério da Saúde, em fase de tratamento:
Serviço de Luta Antituberculosa (SLAT), incorporado em 2006, reúne cerca 6300 monografias e periódicos que versam sobre Tuberculose. Inclui informação específica sobre Tórax-Pulmão-Tuberculose, Climatologia-Meteorologia-Sismologia e outra de carácter genérico no domínio da Medicina e Ciências afins, de grande relevância para o estudo da tuberculose em Portugal.
Secretaria-Geral do Ministério da Saúde, com data de integração de 2007, é composto por 2660 espécies (monografias e publicações periódicas). Contém informação bibliográfica no domínio da Saúde, nomeadamente publicações na área da administração de serviços de saúde, estatística e publicações editadas pela OMS.
A consulta às obras do Fundo Geral é de livre acesso, de presença e domiciliária sob reserva, encontrando-se a informação organizada por grandes áreas temáticas, de acordo com a classificação da National Library of Medicine (Bethesda, Maryland, USA).
A actualização do acervo bibliográfico processa-se mediante oferta, permuta ou compra. A política de aquisições por compra que tem vindo a ser seguida, privilegia as propostas elaboradas pelas unidades operativas do INSA, visando apoiar essas áreas de acção e investigação em ciências da saúde.