A função Referência engloba as seguintes actividades:
- Elaborar documentos normativos ou recomendações que promovam as boas práticas em matéria de saúde ambiental e ocupacional e a harmonização de metodologias;
- Organizar Ensaios de Comparação Interlaboratorial nas suas áreas de actividade:
- Microbiologia de águas - Programa EQUASE;
- Microbiologia do ar
- Desenvolver e validar novas metodologias analíticas de acordo com as necessidades e prioridades em saúde;
- Distribuir materiais de referência;
- Promover a articulação com outros laboratórios nacionais, nomeadamente Laboratórios de Saúde Pública;
- Participar em Comissões Técnicas de Normalização;
- Cooperar com Instituições internacionais
- ECNIS (Environmental Cancer Risk, Nutrition and Individual Susceptibility);
- Centro Colaborador da OMS - Network Occupacional Heath.